在帮助灰原找回弄丢的比护选手的手机挂件之后，虽然手机挂件已经弄脏了，还有些损坏，不过柯南还是拿到了ＡＰＴＸ４８６９解毒药剂，得以变回新一和小兰一起去参加京都修学旅行。
就在日本京都清水寺，在神助攻之下，园子定格到一张新一小兰两人非常甜蜜的合照！不过呢，新一因为害羞，假装感冒让小兰不要靠得那么近。
这边被调侃的两个人，一个靠近对方就会脸红心跳，一心牵挂对方；而另一个已经将自己代入到太太的角色，并开始考虑要不要来一个ｋｉｓｓ！两人都在意对方又比较羞涩，之间的互动也充满了粉红泡泡。而新一由于跟朋友承认和小兰接过吻，被小兰恼羞成怒地质问，我们本来就没这回事，发生了倒也罢了，关键是你要行动啊。
准备离开清水寺的时候，新一他们遇上女演员鞍知景子一行人，并得知他们的一位伙伴也曾经在此坠落。鞍知请求新一帮忙查明出栗的死因，就在新一准备调查时，命案发生了。剧作家西木被害，犯案现场还被比拟成了天狗传说……
而另一边，世良似乎开始怀疑新一的身份。新一能否破解这个案件，马甲又会不会掉下……
